ciao
la scelta tra hotel e casa dipende da cosa volete fare, considerate che se siete in casa dovete pulire perché lasciarla "sporca" o non ben pulita poi dovete pagare una cauzione, e poi c'è il fatto di cucinare, se ci riuscite in tutto questo, ecco delle case per mykonos:
http://www.homelidays.it/IT-Case-Vacanze/gr_cyclades_mykonos_gr/list_r2.asp
http://www.venere.com/it/appartamenti/grecia/mykonos/
oppure puoi controllare questi pacchetti viaggio del sito volagratis, vedi che non ci sono solo partenze da milano, sinistra dei pacchetti ci sono anche altre città
infine c'è un sito si chiama lastimunte puoi combinare varie cose insieme, cioè volo+hotel oppure separatamente
http://www.it.lastminute.com/
http://vacanze.volagratis.com/offerte/vacanze/mykonos